Desaparecen directorios completos, help

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[moddingBogota]

Amigos laneros, creo que tengo un virus en mi equipo pero el antivirus no lo ha detectado (kaspersky), hay muchos directorios en mi pc que no puedo ver pero siguen ocupando espacio en el disco, necesito recobrar esos directorios, a alguien le ha pasado eso?.
Tengo el EasyRecovery Professional pero como no se la naturaleza del problema no lo he utilizado para no dañar nada.

Mas datos, tengo Win XP SP2 con todos los parches, tengo dos discos SATA y el problema es en los dos.

[pata_de_jaguar]

trata de eliminar el virus primero, con algun scanner online o desde DOS, despues le pasas algun recovery.

[moddingBogota]

Muchas gracias por la colaboración, lo arregle con norton disk doctor 2005.