Ayuda javascript y c#

Hola que tal.....

quiero saber como en un archivo aspx hacer referencia a un archivo javascript en el cual tengo una funcion que me levanta pupups.

y como hacer el llamado a esta funcion desde un archivo en c#

ya que cuando hago lo siguiente:

string open = @"<script type='text/javascript'>window.open('Pagina.aspx', '_blank' ,'menubar = no ; resizable = yes ; left = 0; top = 0; scrollbars = yes');</script>";
Response.Write( open );

el popup queda detras de la pagina que que hace el llamado,

la funcion que cree es esta:

function openPopup(){
Pagina= window.open("'Pagina.aspx'", "Pagina", "left=0, top=0, menubar=no, status=yes, location=no, toolbar=no, scrollbars=yes, resizable=yes");
Pagina.moveTo(0,0);
Pagina.resizeTo(screen.availWidth,screen.availHeight);
Pagina.focus();
}
pero no se como referenciar esta funcion en el aspx ni como llamarla en el archivo .cs