En mi opinion personal, DEPENDE
Si usas el PC mas que todo para jugar o realizar actividades que requieran mucho rendimientro grafico, es mejor una desktop (o una notebook con una tarjeta de video poderosa de entrada)
Si la usas mas para navegar en internet, y te gustaria estar conectado la mayor parte del tiempo, sin tener que depender de un cable de red, es mejor la notebook
Todo esta a tu gusto.
En cualquier caso, no te vayas a arrepentir despues de la eleccion que hayas tomado (a menos que tengas bastante plata, ahi sí que puedes comprar lo que quieras XD)
Salu2