Hi tengo un problema con ffmpeg PHP y un servidor windows 2008

hi tengo un pequeño problema con la funcion de ffmepg primero hice todo en mi servidor propio que es en una maquina con XP y apache (XAMPP) un procesador dual core y funciono. Después pase a un servidor con un xeon windows 2008 pero versión 32 bits aquí trono por que se quedo esperando mucho tiempo y nunca realizo ni una conversión y después de un rato todas las paginas de ese servidor fueron inaccesibles hasta que se reinicio. Ahora pase a un servidor con xeon windows 2008 y (XAMPP) pero windows es 64bits y ahí solo funciona por linea de comandos (msdos) pero por PHP no lo ejecuta ni siquiera marca algún error solo ignora mi instrucción si alguien sabe algo por favor ayuden me ya leí que ffmpeg solo quiere a los linux y que no funciona en 64 pero si no funciona en 64 como funciona por linea de comandos bueno espero explicar lo suficientes y gracias de antemano.