Abrir media player, te metes a opciones, te metes en la opcion output de Playback y alli seleccionas en las opciones de DirectShowVideo la que dice VMR9(renderless).
Si keres reinicias aunque no recuerdo si es necesario. Alli ya podes abrir el archivo y cargar los subtitulos via file-->Load subtitles. Asi no es necesario que tengan el mismo nombre y esten en la misma carpeta, auqnue lo recomendable es eso para que te ahorres estar abriendolos cada vez.
Saludos!