Ayuda super urgente

Amigos necesito ayuda super urgente.

Bueno resulta que me pidieron el favor, que si yo podia eliminar unos virus de dos pcs, en los 2 estaba el famoso mago merlin, con sus groserias , los pcs los maneja unas damas ya se imaginaran el mago diciendoles que se las va ****************** jjajaj.,bueno instale el NOD32, actualizado, y se lo configure como aconsejan hacerlo, y en modo a prueba y errores realice el scaneo, efectivamente se encontraron virus. Pero el problema esta en que estas chicas manejan software de contabilidad como monica 7 y siigo, y alli manejan la contabilidad de muchas empresas. los equipos reiniciaron bien, pero parece que un virus afecto los EXE, y ahora no se ejecutan , ni los programas de contabilidad, ni word, nero, adobe acrobat 7.0, y muchos programas quedaron sin servir.
Trate de reparar xp dejando los datos intactos, pero en la reparacion el sistema me arrojo muchos errores, y al final el xp funciono otra vez, pero los programas no.

Mi pregunta es.....
****como recupero la funcionalidad de los programas?

****monica 7 y siigo no funcionan y alli hay datos muy importantes que solucion hay?

****es necesario salvar datos..pero como puedo hacer funcionar el nero?

porque trato de reinstalar programas, ellos instalan pero al ejecutarlos , aparece la ventana con que aplicacion desea abrir el programa?

Estoy en aprietos, las chicas estan desesperadas y me van colgar de los huevos si se llegan a perder datos de las empresas que ellas les maneja la contabilidad.

Espero pronta ayuda.

bueno muchas gracias por sus respuestas.....estare atento a sus opiniones.... la ayuda de ustedes es importante!!!!!!! thx