Saludos, como diseñador llevo años trabajando con gifs para diferentes motivos, ya sea para paginas web, cd interactivos, juegos, etc... y siento que uno de los mejores programas para hacer gisfs es el easy gif animator, por su facil uso y completo pack de opciones desde el tiempo de cada imagen hasta remplazar los colores repetidos, se los recomiendo ampliamente. Por mi parte los gifs los hago en el programa en que hago el dibujo, ya sea corel, ilustrator, free hand, photoshop, etc..., aunque creo que los mejores es cuestion de animacion se refiere es el flash,el rave y el swish, en estos hago principalmente los gifs animados.
Ejemplo de gif realizado en Corel Rave:
Tamaño: 128 x 160 (ParaZ520)
Dibujo vectorizado y color: Corel draw
Animación de frames: Swish y Flash
Combinación de colores a paleta a 256 colores: Corel Rave
Compresión y tiempos de frame: Easy Gif Animator
Este personaje (El cual es una versión en caricatura de mi) es parte de un juego que inclui en un cd interactivo para un periodico. Lo padre de este gif es que gracias a la compresion del easy gif animator solo pesa como 150 kb, impresionante para la cantidad de imagenes que contiene, y podria reducirlo todavia mucho mas, pero tendria que cambiar de paleta y esta es la mas completa a mi gusto.