Lo mejor es tener a la mano, lejos de todo lo demás, una copia de Partition Magic por si se decide que la mejor solución es borrar absolutamente todo.
Los que trae linux son muy útiles también, y pues si se le quita o se le pone a windows, no se pone bravo, porque al menos el XP logra arreglárselas para ajustar la tabla de archivosy demás... cosa que es normalmente más efectiva con NTFS que con FAT. De resto, cualquier programa para administrar particiones lógicas no es muy recomendable /yo conocido.