Bueno, aunque no estoy muy enterado del problema, mi comentario puede ser de gran ayuda.... Max... Mirá, no has visto cuando está arrancando el PC, que antes de arrancar el sistema operativo, aparece una lista grande de nombres raros y a los lados unos números? Casi en todas las boards modernas sale esto.. AHí aparece los dispositivos conectados al sistema... Multimedia Device puede ser por ejemplo una tarjeta de sonido, o una decompresora de DVD o una tarjeta de televisión.... La VGA no recuerdo como sale (VGA Display... o algo así... Debe ser obvio)....
Entonces, según recuerdo en mi bios, esto de control de IRQs es bastante dificil... Sólo me deja decirle por ejemplo que una IRQ la marque como reservada o cosas así... Creo (creo) que tambien está la opción de asignarle IRQ a algunos aparatos, pero no es tan fácil como decirle IRQ 16 = VGA display.. no....
Cuando tengas problemas con el IRQ, y necesites que este cambie, lo mejor es empezar a cambiar todos los dispositivos de PCI... El AGP obviamente no lo puedes cambiar, entonces cambia el resto de dispositivos PCI... Más fácil aún.... Quítelos todos (TODOS) y mire si el problema se soluciona...
Hay otra opción en la bios que es bueno activarla tambien, y es Assign IRQ to VGA (algo parecido hehe)... Búsquela y actívela....
Espero que esto ayude.