A ver, respondiendo a Axelbeny, como yo ya habre mencionado, lo mejor es guardar en formato MAP, ya que el formato interno del GTK no es Importable por el mismo programa (una dificultad a la que yo tambien me enfrente). Solo hagan los brushes, la parte fisica del mapa y lo guardan en MAP, despues, le colocan las entities.
ChronozX, la solucion, se encuentra en el panel de texturas. Se selecciona, solo el "lado" que se necesita centrar y se ajustan los valores de OriginX y OriginY... Toca ajustarlo pixel por pixel. Pronto colocare un screenshot, me toca volver a instalar el GTK, pero todo sea por la documentacion.