No sé si las máquinas que he visto son casos especiales pero el xp siempre ha funcionado mejor en un ambiente casero que el 2000. Claro que si instalas el 2000 a secas va a andar más rápido, pero al instalarle el sp4 te puede quedar más lento que el xp. Especialmente cuando uno ejecuta diversas tareas he notado que el xp es más eficiente que el 98. A veces lo que puede ocurrir en que no te detecte el controlador IDE y el disco trabaje en modo PIO, que en tu disco puede ser de más o menos 7MB por segundo. Al instalar el controlador IDE correcto esto aumenta unas cuatro a cinco veces, depende de la tecnología del disco. Eso me ocurrió con una pcchips 758 pc133. Me dí unas vueltas por la web del fabricante hasta que encontré el controlador IDE (del sis620 creo que era).
El corel 12 no lo he probado, pero al menos el 10 dejaba lenta todas las máquinas en que lo vi funcionando, parece que instala algunas cosas de basic en el sistema que lo ralentizan.
Ya que tienes 40GB de espacio en disco prueba hacer una partición y así puedes tener el 98se y el xp, para diferentes tareas y mientras aprendes a configurar los drivers para tu placa.
Recuerda que los fabricantes de hardware se tienen que adaptar a los sistemas operativos y no al revés como se podría pensar, así que cuando tu placa fue fabricada no fue diseñada para trabajar con el xp y puedes tener conflictos con tus drivers.
Puede ser que los dos módulos de memoria no sean exactamente iguales y se "confundan" un poco al trabajar juntas, ha pasado, pero no es muy probable.
Si la conexión a internet que tienes es vía telefónica nunca va a ir rápido. Si es banda ancha vía puerto USB, entonces probablemente tampoco, ya que los puertos USB te consumen "ancho de banda" del computador que tienes, y si el computador es lento, la conexión es lenta. Ah, y está le quita recursos a los puertos IDE, por lo que te ralentiza todo el sistema. Para sacarle todo el probecho a una conexión USB hay que tener un computador más rápido.
En resumen te recomiendo crear una partición aparte para el xp mientras ves el tema de las compatibilidades y puedes cambiar definitivamente de sistema. Y no uses el 2000, ya que es mucho más complejo sacarle provecho y configurarlo que el 98 y el xp, se pone lento con los service pack y te vas a volver loco tratando de encontrar funciones como el msconfig (conozco el truco, pero se sale del tema). Y tiene problemas con muchos juegos por lo que he escuchado.
Suerte.