Si están instalados en el disco duro no se trata del lector, porque en esos casos el sistema sólo verifica al principio que el disco esté insertado, pero después la unidad de DVD permanece inactiva.
Hay juegos que hacen un uso más intensivo de los procesadores y se calientan más después de un rato, así que los ventiladores también se aceleran a medida que aumenta la temperatura (son de velocidad variable) y con esos juegos mi consola también empieza a sonar como un avión, pero es parte del funcionamiento normal... en el PS3 sucede lo mismo con juegos como Uncharted 2 y 3 o God of War 3 que evidentemente ponen a sudar la consola, mientras que al jugar otros títulos menos intensivos con la CPU, la máquina permanece silenciosa casi todo el tiempo.
También puede ser síntoma de una mala ventilación, bien porque la consola tiene las rejillas obstruidas con polvo o pelusa, o porque la tienes en un lugar en donde no hay muy buen flujo de aire y se está encerrando el aire caliente. Si empieza a sonar feo incluso con jueguitos sencillitos de XBLA o con la consola quieta en el menú, es una mala señal.
Claro, tampoco explicaste con detalle a qué te referías con "suena raro".... si lo que estás escuchando no son los ventiladores sino crujidos, chispas, pitos, o la voz del Major Nelson diciéndote que asesines al primer ministro de Malasia, entonces el problema puede estar en otra parte y sería recomendable que te la revisen antes de que se frite del todo.