Pues eso es cuestión más que todo de gustos y de como le haya ido en la fiesta.
Uno cuando compra una DSLR no compra una cámara, compra un sistema: cuerpo, lentes, flashes, etc.
Ambos son muy buenos, Canon y Nikon son las marcas top y compre lo que compre le va a salir bueno, su limitación no va a ser el equipo.
Ahora, en mi opinión personal, he usado cámaras Canon y Nikon de todas las gamas y estoy convencido de algo, en las digicams, Canon, en las DSLR, Nikon.
Yo antes era canonero, pero Nikon en DSLR para mi es lo mejor en cuando a ergonomía y calidad, ojo, no demerito Canon, simplemente después de usar ambas marcas en condiciones reales, me quedo con la Nikon toda la vida.